Prensip k ap travay nan ekipman tretman dechè medikal se sitou elimine konplètman mikwo-òganis patojèn ak sibstans danjere nan fatra a atravè mwayen fizik, chimik, oswa tèmik, asire sekirite fatra a ak inofansif. Ekipman an premye kolekte dechè medikal nan chanm tretman an atravè yon sistèm transporteur fèmen pou anpeche flit oswa kontaminasyon pandan transpò.
Pandan pwosesis tretman an, diferan kalite ekipman anplwaye diferan teknoloji. Aparèy ensinerasyon segondè-tanperati itilize tanperati ki wo ki te pwodwi pa konbisyon pou konplètman oksidasyon fatra a, detwi eleman danjere; esterilizasyon vapè oswa ekipman dezenfeksyon vapè wo-presyon itilize vapè wo-tanperati, wo-presyon pou touye bakteri, viris, ak lòt mikwo-òganis nan fatra a; mikwo ond oswa ekipman dezenfeksyon chimik sèvi ak chofaj mikwo ond oswa reyaksyon chimik pou fè fatra a pa enfektye.
Apre tretman an, dechè a anjeneral sibi etap pwosesis segondè tankou refwadisman, kraze, oswa solidifikasyon pou asire sekirite li ak fyab pandan transpò ak eliminasyon final la. Tout pwosesis la kontwole pa yon sistèm kontwòl otomatik ki kontwole tanperati, presyon, ak estati opere. Nan ka nenpòt ki anòmal, ekipman an ka otomatikman ajiste oswa sispann operasyon, asire sekirite operatè ak ijyèn anviwònman an.